The complete mitochondrial genome of the tapeworm Cladotaenia vulturi (Cestoda: Paruterinidae): gene arrangement and phylogenetic relationships with other cestodes

Guo, Aijiang

doi:10.1186/s13071-016-1769-x

Table 2 Properties of protein-coding genes, length of the mt genomes and rRNA genes and AT content of cestode mt genomes

From: The complete mitochondrial genome of the tapeworm Cladotaenia vulturi (Cestoda: Paruterinidae): gene arrangement and phylogenetic relationships with other cestodes

Gene	Species
Gene	T. s.	T. a.	E. g.	E. m.	H. k.	H. p.	V. m.	D. c.	A. p.	A. m.	H. d.	C. v.
Number of aa
cox3	214	214	215	215	214	214	215	215	214	214	216	214
cytb	355	355	355	355	355	354	355	360	366	366	365	364
nad4L	86	86	86	86	86	86	86	86	86	86	86	86
nad4	403	417	419	404	416	416	419	415	415	415	409	414
atp6	171	171	170	171	172	171	171	171	171	171	171	171
nad2	293	293	293	293	295	294	291	290	291	291	293	291
nad1	297	297	297	297	297	298	297	297	296	296	296	296
nad3	115	115	115	115	113	113	115	114	115	115	115	115
cox1	539	539	557	535	543	538	539	580	530	529	517	527
cox2	193	191	193	193	194	194	192	191	191	191	192	193
nad6	150	150	151	151	150	149	152	151	152	152	152	151
nad5	522	522	523	524	522	524	522	521	526	526	524	522
Length of rRNA gene (bp)
rrnL	980	975	967	983	960	961	963	970	981	973	967	964
rrns	705	731	726	704	728	730	727	729	724	724	709	715
Deduced initiation codon
cox3	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	GTG
cytb	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	GTG	GTG	ATG	ATG
nad4L	ATG	ATG	GTG	GTG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	GTG	ATG	ATG
nad4	GTG	ATG	ATG	ATG	GTG	ATG	ATG	GTG	ATG	GTG	ATT	GTG
atp6	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG
nad2	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG
nad1	ATG	ATG	GTG	ATG	GTG	ATG	ATG	ATG	ATG	GTG	ATG	ATG
nad3	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	GTG
cox1	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	TTT	GTG
cox2	ATG	ATG	GTG	GTG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	GTG
nad6	ATG	GTG	ATG	ATG	GTG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG
nad5	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG	ATG
Deduced termination codon
cox3	TAG	TAG	TAG	TAG	TAA	TAA	TAG	T	TA	TA	TAG	TAA
cytb	TAA	TAA	TAA	TAA	TAA	TAA	TAA	TAG	TAG	TAA	TAG	TA
nad4L	TAA	TAG	TAA	TAG	TAG	TAA	TAG	TAG	TAG	TAG	TAG	TAA
nad4	TAG	TAG	TAG	TAG	TAG	TAA	TAA	TAA	TAA	TAG	TAG	TAA
atp6	TAA	TAA	TAG	TAG	TAG	TAG	TAA	TAG	TAG	TAG	TAG	TAA
nad2	TAA	TAA	TAG	TAG	TAA	TAA	TAG	T	TAG	TAG	TAG	TAA
nad1	T	T	TAA	TAG	TAG	TAG	TAG	TAA	TAA	TAA	TAG	TAA
nad3	TAG	TAG	TAG	TAA	T	TAG	TAG	TAG	TAA	TAA	TAG	TAG
cox1	TAG	TAA	TAA	TAG	TAA	TAG	TAG	TAA	TAA	TAG	T	TAG
cox2	TAG	TAG	TAG	TAG	T	T	TAG	TAG	TAG	TAG	TAA	TAA
nad6	TAG	TAA	TAG	TAA	TAG	TAA	TAA	TAG	TAG	TAG	TAA	TAG
nad5	TAA	TAA	TAA	TAA	TAG	TAA	TAA	TAA	TAG	TAA	TAG	TAA
Length of mt genome (bp)
–	13,709	13,703	13,610	13,738	13,792	13,482	13,582	14,296	14,459	13,759	13,900	13,411
AT content of complete mt genome (%)
–	72.05	71.40	67.02	69.04	72.77	71.40	71.37	72.89	71.05	70.80	71.04	74.64

Note: Results obtained from GenBank accessions
Abrreviations: T. s. Taenia solium, T. a. Taenia asiatica, E. g. Echinococcus granulosus, E. m. Echinococcus multilocularis, H. k. Hydatigera krepkogorski, H. p. Hydatigera parva, V. m. Versteria mustelae, D. c. Dipylidium caninum, A. p. Anoplocephala perfoliata, H. d. Hymenolepis diminuta, D. n. Diphyllobothrium nihonkaiense, D. l. Diphyllobothrium latum, D. g. Diplogonoporus grandis, D. b. Diplogonoporus balaenopterae, S. e. Spirometra erinaceieuropaei, C. v. Cladotaenia vulturi

Back to article page

ISSN: 1756-3305

Contact us

Submission enquiries: journalsubmissions@springernature.com

Parasites & Vectors

Contact us